Oprócz wynagrodzeń pracownicy bardzo często otrzymują różnego rodzaju ryczałty i deputaty. Część z nich wyłączona jest z podstawy wymiaru składek, a tym samym nie jest uwzględniana przy liczeniu świadczeń chorobowych. Część zaś objęta jest składkami, zwiększając podstawę świadczeń. W praktyce występują też sytuacje, że mimo objęcia danej wypłaty wyłączeniem zawartym w rozporządzeniu składkowym należy ją przyjąć – w ograniczonym zakresie – do podstawy świadczenia chorobowego. Dodatkowe wątpliwości pojawiają się, jeżeli w okresie branym pod uwagę przy obliczeniach danego świadczenia pracownik przebywał na zwolnieniu lekarskim, zachowując prawo do całości lub części pobieranego ryczałtu albo deputatu.